Организационная структура ОИ, а также распределение ответственности обеспечивает для каждого специалиста ОИ его конкретную сферу деятельности, пределы его полномочий и выполнение всех процедур, связанных с проведением инспекций, входящих в заявленную область деятельности.
В соответствии со структурой, в состав ОИ ФГБУ «Забайкальский референтный центр Россельхознадзора» входят инспекторы.
Функции, ответственность и полномочия персонала ОИ изложены в должностных инструкциях, утвержденных в соответствии с порядком, установленным в Учреждении.
В ОИ установлен порядок обеспечения независимости и беспристрастности: