Учредителем Федерального государственного бюджетного учреждения «Забайкальский референтный центр Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору» является Российская Федерация, полномочия учредителя осуществляет Федеральная служба по ветеринарному и фитосанитарному надзору (Россельхознадзор), учреждение находится в ведении Россельхознадзора.
Начальник отдела сертификации и классификации средств размещения - Синякина Елена Борисовна